MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	AAT	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017233	ATTA	2	8	82	89	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017233	TAA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017233	TAT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017233	GTC	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017233	TC	3	6	184	189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017233	T	6	6	210	215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017233	CT	3	6	221	226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017233	ATTT	2	8	280	287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017233	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017233	TAT	2	6	322	327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017233	CAAA	2	8	332	339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017233	AT	3	6	343	348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017233	TTAA	2	8	353	360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017233	ATTA	2	8	368	375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017233	TAAT	2	8	377	384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017233	TTA	2	6	389	394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017233	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017233	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017233	ATCT	2	8	1425	1432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017233	ATT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017233	AGG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017233	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017233	TTCTTT	2	12	2238	2249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017233	T	7	7	2247	2253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017233	T	7	7	2270	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017233	GTC	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017233	CCA	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017233	A	7	7	2352	2358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017233	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017233	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017233	AAC	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017233	A	6	6	2811	2816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017233	TAAA	2	8	2825	2832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017233	TGG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017233	TTTA	3	12	2869	2880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017233	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017233	ATT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017233	AAT	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017233	AAAT	2	8	2992	2999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017233	ATA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017233	ATT	2	6	3053	3058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017233	AT	4	8	3064	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017233	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017233	ATATT	3	15	3100	3114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017233	ATATA	2	10	3117	3126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017233	TAAA	2	8	4115	4122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017233	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017233	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017233	TAA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017233	AT	3	6	4236	4241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017233	ACT	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017233	ATT	3	9	4394	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017233	T	8	8	4412	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017233	AATA	2	8	4423	4430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017233	A	6	6	4433	4438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017233	TAAA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017233	TTA	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017233	TAA	2	6	4527	4532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017233	A	6	6	4917	4922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017233	AT	3	6	4983	4988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017233	TA	3	6	5006	5011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017233	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017233	CTT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017233	TTA	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017233	T	6	6	5870	5875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017233	CTT	3	9	5993	6001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017233	T	7	7	6039	6045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017233	ATT	2	6	6066	6071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017233	T	7	7	6070	6076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017233	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017233	T	6	6	6102	6107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017233	CAA	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017233	AGT	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017233	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017233	A	6	6	6178	6183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017233	AAT	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017233	TAC	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017233	ATT	2	6	6249	6254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017233	CTATT	2	10	6264	6273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017233	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017233	TTA	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017233	T	6	6	6329	6334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017233	A	6	6	6374	6379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017233	AT	3	6	6392	6397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017233	T	6	6	6404	6409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017233	AGT	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017233	T	7	7	6481	6487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017233	T	6	6	6497	6502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017233	A	6	6	6513	6518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017233	ATTAA	2	10	6538	6547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017233	ATTA	2	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017233	TAA	2	6	7498	7503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017233	ATTT	2	8	7508	7515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017233	A	6	6	7520	7525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017233	AAG	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017233	GAT	2	6	7557	7562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017233	AAAAT	2	10	7567	7576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017233	TGG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017233	ATT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017233	AAAG	2	8	7663	7670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017233	TAC	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017233	TTA	2	6	7738	7743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017233	A	6	6	7748	7753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017233	ATT	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017233	A	7	7	7781	7787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017233	A	8	8	7798	7805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017233	AAT	2	6	7861	7866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017233	ATC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017233	CAT	2	6	7984	7989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017233	TCA	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017233	AT	3	6	8042	8047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017233	ATTAA	2	10	8051	8060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017233	TAA	3	9	8058	8066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017233	TTAT	2	8	11961	11968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017233	T	6	6	11974	11979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017233	ATA	2	6	11997	12002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017233	T	6	6	12017	12022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017233	AC	3	6	12279	12284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017233	T	6	6	12315	12320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017233	A	6	6	12562	12567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017233	CAA	2	6	12597	12602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017233	G	6	6	12610	12615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017233	C	6	6	12616	12621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017233	AAT	2	6	12622	12627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017233	A	6	6	12642	12647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017233	TAA	2	6	12660	12665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017233	A	7	7	12684	12690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017233	GTT	2	6	12729	12734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017233	TCAAA	2	10	12753	12762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017233	TTA	2	6	12788	12793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017233	ATA	2	6	12806	12811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017233	TAA	2	6	12823	12828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017233	A	6	6	12827	12832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017233	TA	3	6	12848	12853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017233	C	6	6	12937	12942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_017233	TAGA	2	8	12956	12963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017233	TAG	2	6	13044	13049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017233	TTA	3	9	13101	13109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017233	A	6	6	13219	13224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017233	A	7	7	13247	13253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017233	TAA	2	6	13294	13299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017233	TAA	2	6	13309	13314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017233	GA	3	6	15632	15637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017233	ATATA	2	10	16279	16288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017233	TAT	2	6	16290	16295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017233	TC	4	8	16317	16324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017233	AGT	2	6	16332	16337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017233	T	7	7	16359	16365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017233	ACT	2	6	16387	16392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017233	TAA	2	6	16419	16424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017233	ATAA	2	8	16775	16782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017233	AT	3	6	16826	16831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017233	CAA	2	6	16864	16869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017233	ATTT	2	8	16891	16898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_017233	ATT	2	6	19321	19326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.